Lietuvos Respublikos Nepriklausomybė – Tautos atgimimas ir nuostabūs permainų vėjai. Paskatinti šių įvykių, Lietuvoje atsiranda pirmieji Valdorfo pedagogikos gyvybiniai impulsai. Nuo 1990 metų kyla įvairios iniciatyvos, gaivinančios sustabarėjusią šalies pedagogiką. Vilniuje, Kaune, Kazlų Rūdoje, Šilutėje aktyvūs mokytojai buriasi į Valdorfo pedagogikos klubus ir studijas bei bendraminčių būrelius.

Mūsų mokykla taip pat prasidėjo nuo Valdorfo pedagogikos bendraminčių iniciatyvos ir praėjo vingiuotą kelią, kol tapo Nepriklausoma Kauno Valdorfo pedagogikos Mokykla:

• 1996 metais Valdorfo klasės (1 - 4 kl.) Kauno m. Šančių vid. mokykloje
• 2000 metais Valdorfo klasė „Animos“ vidurinėje mokykloje
• 2001 metais Valdorfo klasės prie Muravos pradinės mokyklos
• 2004 metais Valdorfo klasės prie Martyno Mažvydo vidurinės mokyklos
• 2008 metais mokyklos tėvų ir mokytojų iniciatyvinė grupė pradeda darbą, siekiant savarankiško Valdorfo mokyklos statuso (devynios Valdorfo klasės prie M. Mažvydo mokyklos)
• 2009 metais  mokyklos tėvų ir mokytojų iniciatyvinė grupė įkuria " Naujos kartos mokykla" asociaciją Kauno Valdorfo mokyklos kūrimui remti;
• 2010 metų birželio 19 d. įsteigiama Nepriklausoma Kauno Valdorfo mokykla
• 2010 metų rugsėjo 1-oji Laisvoje ir nepriklausomoje Kauno Valdorfo mokykloje (1 – 5 klasės ir 2 ikimokyklinės - priešmokyklinės grupės)
• 2011 metais intensyviai pradeda veikti nepriklausomos Kauno Valdorfo mokyklos tėvų ir mokytojų iniciatyvos, siekiant pilnai išnaudoti mokyklos patalpas